本会会徽图案上方为深圳市医师协会的英文名称ShenZhen Medical Doctor Association, 中央是深圳市医师协会的英文名称缩写SZMDA以地球图案为衬底,以绿色为基本色。上方是“蛇杖”,下方是“大鹏展翅”的图形。寓意深圳版图的形状和深圳的别名“鹏城”。